Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2bQ9JME9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms