Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Trappc2lQ9JME7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms