Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms