Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgm1Q9JLF6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgm1Q9JLF6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Tgm1Q9JLF6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tgm1Q9JLF6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tgm1Q9JLF6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tgm1Q9JLF6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tgm1Q9JLF6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms