Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TefQ9JLC6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefQ9JLC6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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