Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms