Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Habp4Q9JKS5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms