Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms