Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gfra4Q9JJT2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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