Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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