Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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OtofQ9ESF1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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