Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms