Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tomm20Q9DCC8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms