Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms