Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrpraQ9DBG7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms