Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Capns2Q9D7J7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms