Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec23bQ9D662 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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