Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sohlh2Q9D489 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms