Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms