Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem53Q9D0Z3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem53Q9D0Z3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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