Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hdhd3Q9CYW4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms