Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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