Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms