Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PsenenQ9CQR7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms