Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim8Q9CQQ0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms