Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TpbpbQ9CQC0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms