Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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