Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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