Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms