Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup155Q99P88 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms