Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms