Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnps1Q99M28 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnps1Q99M28 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnps1Q99M28 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnps1Q99M28 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnps1Q99M28 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnps1Q99M28 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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