Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp16Q99LG0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms