Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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