Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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