Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms