Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctu1Q99J10 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctu1Q99J10 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms