Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms