Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc8Q8VD72 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc8Q8VD72 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms