Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms