Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms