Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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