Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms