Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms