Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc73Q8CDM4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc73Q8CDM4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms