Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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