Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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