Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms