Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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4933409G03RikQ8C5U0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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