Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc113Q8C5T8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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